A Farmácia Hospitalar do Complexo é referência na região, oferecendo um serviço altamente especializado. O sistema de distribuição de medicamentos é totalmente informatizado, realizando a rastreabilidade de todas as doses dispensadas. A equipe de farmacêuticos valida 100% das prescrições médicas, tornando o processo mais seguro.
Em agosto de 2015 foi inaugurada a Central de Diluição, onde preparamos as doses dos medicamentos quimioterápicos e a diluição dos medicamentos injetáveis. Este serviço permite o envio das doses individualizadas de acordo com a necessidade de cada paciente, proporcionando total segurança e uma considerável economia.